截至年7月，阿克苏地区共辖9个行政区，包括2个县级市、7个县。分别是阿克苏市、库车市、新和县、沙雅县、拜城县、温宿县、阿瓦提县、乌什县、柯坪县。
县级市
1.阿克苏市
阿克苏市，隶属新疆维吾尔自治区阿克苏地区，位于塔克拉玛干沙漠西北边缘，塔里木河上游，因水得名，维吾尔语意为“白水城”，意为“清澈的水”。
古为中国秦汉西域三十六国的姑墨、温宿两国属地，是古丝绸之路上的重要驿站，也是龟兹文化和多浪文化的发源地，素有“塞外江南”之美誉，是阿克苏地区政治、经济、文化中心。
2.库车市
库车市，新疆维吾尔自治区阿克苏地区辖县级市，总面积1.52万平方公里。有国道线、线在县城交汇，南疆铁路横穿县域，民航直达乌鲁木齐，成为南疆集航空、铁路、公路相交织的客、货运集散地。
县
3.温宿县
温宿县，隶属于新疆维吾尔自治区阿克苏地区，位于西部天山中段的托木尔峰南麓，总面积.3平方千米。温宿是古西域三十六国之一姑墨国所在地，也是古丝绸之路上的著名驿站商埠。
4.沙雅县
沙雅是古丝绸之路的重要通道，古龟兹国的重要组成部分。沙雅县总面积3.2万平方公里。沙雅县是世界四大文明汇集地之一。中原汉文化、南亚佛教文化、波斯阿拉伯文化、希腊罗马文化在此交融。
5.新和县
新和县，隶属于新疆维吾尔自治区阿克苏地区，位于新疆维吾尔自治区西南部，面积.46平方公里。
新和县，因渭干河流经全县，水源充足而得名托克苏县，维吾尔语，意为“丰水”、“水足”。
6.拜城县
拜城县，隶属于新疆阿克苏，位于天山中段南麓，总面积平方千米。“拜”为“巴依”一词音译变音而来，意为富庶。
7.乌什县
乌什县位于新疆阿克苏地区西部，乌什县总面积.17平方公里。乌什县被誉为“中国西部生态明珠”，享有“半城山色半城泉”、“塞外江南”之美称，有玛尔浆湖、柳树泉、钟鼓楼等旅游景点。
8.阿瓦提县
阿瓦提县隶属于新疆维吾尔自治区阿克苏地区，是地区重要的粮食、棉花和水果基地，辖区面积平方千米。
阿瓦提县是全国优质棉生产基地、著名的中国棉城、中国长绒棉之乡、中国慕萨莱思之乡和多浪文化之乡。
9.柯坪县
柯坪县，明末清初时，汉族称柯坪为克勒品，维吾尔语称柯尔坪，直至年设分防县丞时才定为柯坪，沿用至今。柯坪，传说为“洪水”或“地窝子”之意。
柯坪县位于新疆南部，阿克苏地区最西端，全县总面积平方公里。