巴楚县地处天山南麓，塔里木盆地和塔克拉玛干沙漠西缘。巴楚县绿洲集中在叶尔羌河和喀什噶尔河沿岸的冲击扇平原上，由西南到东北呈狭长地形。
东与和田阿瓦提县、墨玉县相望，南与麦盖提县、莎车县、和田皮山县为邻，西与伽师县、岳普湖县毗连，北依柯坪山和喀拉塔格山为界与阿克苏柯坪县、克州阿合奇县接壤，图木舒克市在巴楚县东部境内。
巴楚，是巴尔楚克的简称。维吾尔语称作玛热勒巴什，旧有玛喇巴什、毛拉巴什等不同译名，意为鹿首。
汉代为西域尉头国地。三国、北魏时属龟兹。隋时属疏勒。唐代为安西都护府下属的尉头州。元代属别失八里行尚书省。明代属东察合台汗国，后属准噶尔。乾隆年间设军台，称巴尔楚克台，为叶尔羌到阿克苏十六军台之一。道光十二年（年）筑玛拉巴什城。民国二年（年）改设巴楚县，属喀什噶尔道。建国后先后属喀什专区、南疆行政区。
年后属喀什地区。
巴楚县辖4个镇、8个乡：巴楚镇、色力布亚镇、阿瓦提镇、三岔口镇、恰尔巴格乡、多提巴格乡、阿纳库勒乡、夏玛勒乡、阿克萨克马热勒乡、阿拉格尔乡、琼库尔恰克乡、英吾斯塘乡；
县境内有下河林场、兵团四十八团、兵团五十二团。政府驻巴楚镇。
巴楚县位于叶尔羌河、喀什噶尔河下游。叶尔羌河由西南向北东贯穿全境，县内流程余千米，叶尔羌河是巴楚县主要水源。喀什噶尔河，在距巴楚县约19千米处，注入小海子水库北闸放水渠内，境内全长千米。
红海水库距县城8千米，草龙水库距县城76千米，卫星水库距县城19.5千米。
巴楚县有胡杨林5万公顷，是世界罕见的大面积胡杨林生长区。
巴楚县地处交通要道，是南疆的交通枢纽和喀什地区的东大门，是古丝绸之路的重要驿站和“丝路明珠”。巴楚境内国道（乌（鲁木齐）红（其拉甫）公路）和巴楚—莎车公路、巴楚—图木舒克公路和南疆铁路贯穿县境，巴楚火车站距县城4.5千米。是中国人流、物流由喀什进入中亚的重要通道，是喀什、克州、和田地区及西藏阿里地区的交通枢纽，也是南疆重要的客货集散地之一。
巴楚县是新疆胡杨文化的发源地，维吾尔族刀郎舞的故乡。巴楚县有1个国家级非物质文化遗产：维吾尔族叼羊；有4个自治区级非物质文化遗产：刀郎木卡姆、维吾尔族叼羊、维吾尔刀郎麦西热甫、维吾尔民族乐器制作技艺（卡龙琴制作）。民族节日有肉孜节（开斋节）、古尔邦节、诺鲁孜节等。还有斗狗、斗羊、斗鸡等习俗。
巴楚县有卡拉姆达尔拜克古墓、唐王城、沙呆提拜克古墓、图木舒克化石群、泽梯木烽火台、琼梯木烽火台、唐代谒者馆遗址、克克勒玛佛教遗址、图木舒克佛教遗址、夏河姑娘坟、恰尔巴格麻扎等历史古迹。
唐王城遗址
即唐代尉头州城遗址，为唐代龟兹国遗迹。当地少数民族称之为“托库孜萨热依”古城，建于公元前年，古城座落在巴楚县城东北60多千米处的代热瓦孜塔格山（大门山）南端山口的北山东侧。城墙用泥土，石头筑成，直径为米，分内城，外城，大外城几个部分。南北各有一道城门，大外城的城墙已风化为一道土梁，城东北延伸至约两千米处的唐王村（今农三师五十一团驻地）。从城内沙土中曾发现毡片、兽骨、木材等物。此外，还出土有钱币、文书和金币。唐王城为新疆境内古丝绸之路中道上的一个重要古城遗址，具有极高的考古价值，被列为自治区重点文物保护单位。
唐代烽火台遗址
位于琼梯木之南、托库孜萨来之北，烽燧以间隔5～10华里的距离一线排列，均系南疆重点县文物考古综合调查组年底新发现。所获遗物种类与琼梯木的一致，考古学家认定这几处均为唐代烽火台遗址。琼梯木和这几处烽燧遗址都是古丝绸之路在悬浑河(即今阿克苏河)至据史德城之间的馆驿护卫建筑。
现代景点有距巴楚县城9千米的红海水上乐园，风景秀丽的红海子水库；距县城24千米的红海乡境内曲尔盖金色胡杨岛度假村